عدم تکامل طبيعى ساختمان‌هاى جنين منجر به شکاف لب يک‌طرفه، دوطرفه و يا همراه با شکاف کام مى‌گردد. به‌طورى‌ که تيغه بينى و کام سخت و نرم، و زبان کوچک يا تشکيل نمى‌شود و يا ناقص تشکيل مى‌گردد. ناهنجارى‌هاى دندانى مانند رديف نبودن دندان‌ها، دندان درنياوردن، و يا جابه‌جائى دندان‌ها در فرد مبتلا ديده مى‌شود (شکل انواع شکاف کام و لب). عوامل متعددى در بروز شکاف کام و شکاف لب دخالت دارند. عوامل ارثى مى‌تواند در بروز شکاف کام يا شکاف لب يا هر دو مؤثر باشد. وجود ناهنجارى‌ها در خواهر و برادر بزرگ‌تر خطر آن را در فرزند بعدى بالاتر مى‌برد. ناهنجارى‌هاى کروموزومى و عوامل محيطى نيز مى‌تواند به بروز شکاف کام يا شکاف لب يا هر دو منجر شوند.